A társak nyertek neki egy bajnoki címet Kispesten
Botka Endre 1994. augusztus 25-én született, Budapesten. A Goldball ’94 volt az első klubja, onnan került a Budapest Honvéd csapatába. Az élvonalban 2014. május 11-én, a Győri ETO ellen mutatkozott be. Abban az idényben három találkozón kapott szerepet az első csapatban. A következő idényre klubja kölcsönadta a Kecskeméti TE gárdájának, amelyben 15 bajnokin játszott 2014 őszén. A következő tavaszra a kispesti klub visszarendelte. Összesen 61 élvonalbeli bajnokit játszott a Honvédban.
Hétszeres bajnok a Ferencvárossal
2017 elején átszerződött a Ferencvároshoz. Az idény végén a Honvéd bajnok lett, őszi szereplései miatt Botka Endre így a kispestiekkel nyerte első titulusát az OTP Bank Ligában. A zöld-fehéreknél eddig hét bajnoki címet nyert, (2018–2019, 2019–2020, 2020–2021, 2021–2022, 2022–2023, 2023–2024, 2024–2025), 2017-ben és 2022-ben Magyar Kupa-győzelmet ünnepelhetett. Szerepelt a Ferencvárossal a Bajnokok Ligája főtábláján (2020), valamint háromszor (2019, 2021, 2022) az Európa-liga főtábláján. A 2022–2023-as idényben ráadásul eljutott a Ferencvárossal a tavaszi folytatásba, nyolcaddöntősként zárt. A 2025-ös tavaszt a Kecskeméti TE-ben töltötte, így ugyanabban a szezonban bajnok is lett, s egyszersmind kiesett az élvonalból. 2025 nyarán visszatért a Ferencvároshoz.
Végigjátszotta a magyarok 2021-es Eb-meccseit
Az A-válogatottban még a Bp. Honvéd tagjaként mutatkozott be, 2016. november 15-én. Részt vett 2021 tavaszán az Európa-bajnokságon, mind a három találkozót végigjátszotta. A nemzeti tizenegyben eddigi egyetlen gólját Andorra ellen lőtte, 2021-ben. A 2024-es Európa-bajnokság selejtezőin négy találkozón kapott szerepet. A skótok ellen lépett pályára a 2024-es Európa-bajnokságon, végigjátszotta a magyar csapat harmadik csoportmérkőzését.